5 stagioni - 99 episodi vedi scheda serie
La terza stagione è nuovamente formata da 22 episodi da 45 minuti. La trama segue due binari separati (anche se talvolta si sovrappongono) che si alternano ad ogni episodio andando ad infittire la trama e rendendola molto più complessa di quanto visto fin’ora. Di fatto è ormai impossibile da seguire per lo spettatore occasionale, in quanto i casi fringe sono ormai unicamente funzionali al disvelamento della trama orizzontale.