Titolo originale: XY (1) - Prima trasmissione: 21 set 2015
Castle racconta la catena di eventi che è partita con una chiamata misteriosa e culminata con la scomparsa di Beckett.
Titolo originale: XX (2) - Prima trasmissione: 28 set 2015
La drammatica catena di eventi che ha portato alla scomparsa di Beckett viene raccontata dal punto di vista della stessa Kate, che lotta per la vita.
Titolo originale: PhDead - Prima trasmissione: 5 ott 2015
Per indagare su un delitto terribilmente cruento avvenuto in un college, Castle si finge un nuovo professore dell'istituto.
Titolo originale: What Lies Beneath - Prima trasmissione: 12 ott 2015
L'idolo di Castle, uno scrittore solitario come un eremita, viene trovato ucciso. Rick è determinato ad occuparsi in prima persona di questo caso.
Titolo originale: The Nose - Prima trasmissione: 19 ott 2015
Un quadro di inestimabile valore viene rubato e la persona che lo stava trasportando uccisa: sul caso indaga Beckett e la sua squadra, aiutati da una donna che ha un'ipersensibilità agli odori.
Titolo originale: Cool Boys - Prima trasmissione: 9 nov 2015
Mentre Beckett è fuori città, Castle si trova a collaborare col detective Slaughter su un caso collegato a un furto di microchip.
Titolo originale: The Last Seduction - Prima trasmissione: 16 nov 2015
Castle organizza qualcosa di speciale per Beckett, mentre Ryan ed Esposito cercano di risolvere i loro problemi.
Titolo originale: Mr. & Mrs. Castle - Prima trasmissione: 23 nov 2015
Castle e Beckett indagano sull'assassinio di un cantante da crociera e finiscono nei guai su un'immensa nave.
Titolo originale: Tone Death - Prima trasmissione: 8 feb 2016
Quando viene rinvenuto un corpo in un teatro dove si è svolto l'ultimo spettacolo di Martha, le indagini di Castle e Beckett li portano nel mondo inaspettatamente pericoloso delle competizioni a cappella.
Titolo originale: Witness for the Prosecution - Prima trasmissione: 14 feb 2016
Castle riesce finalmente ad avere un suo momento in tribunale quando viene chiamato a fare da testimone per un omicidio che è avvenuto cinque mesi prima. Ma quando vengono fuori delle nuove informazioni, lui e Beckett dovranno lottare contro il tempo per fare davvero giustizia.
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Titolo originale: Dead Red - Prima trasmissione: 15 feb 2016
Quando il figlio di un diplomatico russo viene scoperto ucciso, Beckett e Castle si trovano in un gioco pericoloso che ha a che fare con crimini e vendette internazionali.
Titolo originale: The Blame Game - Prima trasmissione: 22 feb 2016
Castle è rapito e costretto a lavorare con degli estranei per risolvere dei rompicapi e giochi mentali, mentre Beckett e il 12esimo distretto devono lottare contro il tempo per salvare Castle e prendere un assassino.
Titolo originale: And Justice for All - Prima trasmissione: 29 feb 2016
Beckett e il 12esimo distretto si occupano di un omicidio di un uomo che faceva il guardiano notturno di uno zoo ed era anche studente di una scuola di lingua inglese per stranieri. Ma quando gli altri alunni della scuola non vogliono collaborare, Castle decide di infiltrarsi come immigrato canadese.
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Titolo originale: The G.D.S. - Prima trasmissione: 7 mar 2016
Castle torna a Los Angeles in cerca di risposte a proposito della sua sparizione di due mesi. Ma durante il suo soggiorno è reclutato dalla G.D.S. (="Greatest Detective Society") per risolvere un omicidio.
Titolo originale: Fidelis Ad Mortem - Prima trasmissione: 21 mar 2016
Quando una recluta dell'Accademia di Polizia della NYPD viene uccisa, Beckett e la squadra si ritrovano immersi nell'ambiente dell'addestramento per investigare sull'omicidio.
Titolo originale: Heartbreaker - Prima trasmissione: 4 apr 2016
Un indizio sulla scena di un omicidio in cui è stato ucciso un autista di un furgone blindato conduce Beckett e Castle a un vecchio caso risolto da Esposito.
Titolo originale: Death Wish - Prima trasmissione: 11 apr 2016
L'assassinio di un uomo connesso con il contrabbando turco porta Castle, Beckett e il 12esimo distretto in cerca di antichità rubate che dovrebbero avere a che fare con la lampada di Aladino.
Titolo originale: Backstabber - Prima trasmissione: 18 apr 2016
Quando Hayley risulta implicata in un attacco cyber-terroristico dopo aver fatto un favore a un vecchio amico, Castle e Beckett si affrettano a ripulire tutte le tracce della sua presenza.
Titolo originale: Dead Again - Prima trasmissione: 25 apr 2016
Quando un ispettore di sicurezza della città sopravvive miracolosamente a un avvelenamento, potrebbe trattarsi di fortuna; ma quando gli capita una seconda volta, è un mistero che Castle e Beckett dovranno risolvere.
Titolo originale: Much Ado About Murder - Prima trasmissione: 2 mag 2016
Dopo che una star del cinema diventato attore di teatro viene misteriosamente ucciso, Castle e Beckett si inoltrano dietro le quinte e vengono a sapere che la vittima aveva molte cose per cui preoccuparsi.
Titolo originale: Hell to Pay - Prima trasmissione: 9 mag 2016
Un omicida scappa dal manicomio criminale in cui era rinchiuso e si dirige nell'ufficio di Castle intenzionato a uccidere la persona che era in parte responsabile del suo arresto. Ma non riuscirà a fare niente perché morirà sull'ingresso.
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Titolo originale: Crossfire - Prima trasmissione: 16 mag 2016
Nell'episodio finale della serie le indagini che partono dal ritrovamento di un corpo carbonizzato nel portabagagli di un'auto finiscono per intrecciarsi con una serie di eventi che coinvolgeranno in prima persona Castle e Beckett.
