11 stagioni - 219 episodi vedi scheda serie
La sesta stagione, composta da 22 episodi di circa 45 minuti, è andata in onda negli Stati Uniti dall'8 novembre 1998 al 16 maggio 1999 su Fox. In Italia la stagione è stata trasmessa tra il 21 marzo 1999 e il 2 aprile 2000 su Italia 1.
Dopo le vicende raccontate nel primo film della serie, gli X-Files vengono riaperti ma non assegnati a Mulder e Scully. Il personaggio di Jeffrey Spender (interpretato da Chris Owens), che era stato introdotto nella stagione precedente, qui viene ufficialmente assegnato agli X-Files insieme all’agente Diana Fowley (interpretata da Mimi Rogers).
